Перед голоданием традиционно очищают организм при помощи клизм. Метод Пракшалана очищение проводит благодаря естественному рвотному рефлексу. В результате полностью очищается пищевод, желудок, двенадцатиперстная кишка, тонкий и толстый кишечник, прямая кишка. В процессе голодания Пракшалана начинает интенсивно работать печень и поджелудочная железа.
Уникальность очищения организма по методу Пракшалана заключается не только в том, что происходит очищение всех отделов пищеварительной системы механическим путем. Но и потому, что осуществляется тонкая чистка на клеточном уровне всех стенок желудочно-кишечного тракта.
Поскольку для выполнения голодания Пракшаланы применяется солёная вода, она и запускает осмотический процесс очищения. В результате солевой раствор вытягивает из эпителиальных клеток пищеварительного тракта вредные вещества и происходит самоочищение клеток. Первым видимым эффектом от голодания Пракшаланы является улучшение состояния кожных покровов человека.